在台灣，醫學教育資源相當豐富且競爭激烈，主要由幾所頂尖的「國立大學醫學院」與專門的「私立醫學大學」組成。
截至 2026 年的最新趨勢，台灣的醫學大學及其醫學院可以大致分為以下四大體系：
1. 頂尖國立大學醫學院
這些學校通常擁有最悠久的歷史、最雄厚的政府預算，以及台灣最頂尖的附設醫院（醫學中心）。
國立台灣大學（台大醫學院）： 台灣醫學界的最高殿堂，擁有台大醫院體系。
國立陽明交通大學（陽明校區）： 前身為陽明醫學院，以基礎醫學與神經科學研究著稱，與台北榮總有深度合作。
國立成功大學（成大醫學院）： 南台灣醫學研究中心，附設醫院為成大醫院。
國立清華大學、國立中興大學、國立中山大學： 這些傳統頂尖頂大近年也開始招收「學士後醫學系」，擴大其在醫學領域的影響力。
2. 傳統私立醫學大學（醫界五校）
這些學校以醫學教育為核心，通常擁有完善的醫療體系與教學傳統。
台北醫學大學 (TMU)： 位於台北市信義區，智慧醫療與護理學科表現強勁。
中國醫藥大學 (CMU)： 位於台中，特色在於「中西醫結合」，在 2026 年的世界大學排名中表現優異。
高雄醫學大學 (KMU)： 台灣第一所私立醫學院，與高醫大附設中和紀念醫院緊密結合，深耕南台灣。
中山醫學大學 (CSMU)： 位於台中，專長於口腔醫學、醫檢等領域。
長庚大學 (CGU)： 背靠台塑集團長庚醫療體系，擁有強大的臨床資源與研究經費。
3. 其他特色醫學院校
國防醫學院 (NDMC)： 培育軍醫的專門學府，校風嚴謹，與三軍總醫院結合。
慈濟大學 (TCU)： 位於花蓮，致力於偏鄉醫療與大體捐贈教育（無語良師），具人文特色。
輔仁大學醫學院： 綜合大學中的醫學系，擁有輔大醫院，學術氛圍較為多元。
馬偕醫學大學： 位於三芝，環境清優，與馬偕醫院體系連結。
義守大學： 設有醫學院，是南部科技與醫學結合的代表之一。
4. 公立與私立的主要差異
| 項目 | 公立 (如台大、陽明交大) | 私立 (如北醫、中醫大) |
| 學費 | 較低 (政府補助多) | 較高 (通常是公立的兩倍) |
| 臨床資源 | 多為公家榮總或台大體系 | 多為體系下之法人醫院或企業醫院 |
| 校園風格 | 綜合研究型，資源跨學科廣 | 專業集中型，醫學氛圍濃厚 |
| 研究特色 | 偏向基礎科學、政策研究 | 偏向臨床應用、智慧醫療與產學整合 |
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